企业清算时，增值税留抵税额能从所得中扣除吗？

根据国家税务总局和财政部联合发布的《关于企业清算业务企业所得税处理若干问题的通知》(财税〔2009〕60号)，企业在进行清算时，需要遵循特定的税务处理规则。这些规则涵盖了从资产评估到债务清偿的全过程。

首先，所有资产必须按照其可变现价值或交易价格来确认转让所得或损失。这意味着企业需要对其持有的资产进行市场估价，以确定它们在清算过程中的价值。

其次，债权清理和债务清偿也是清算过程中的重要环节。企业需要对所有的债权进行核实，并确保债务得到妥善解决，以避免未来的法律纠纷。

第三点是改变持续经营核算原则，对于预提或待摊性质的费用进行处理。这要求企业在清算期间重新评估这些费用的合理性，并进行相应的调整。

第四，依法弥补亏损，确定清算所得。企业需要计算其累计亏损，并在清算所得中予以扣除，以确保最终的税务处理符合法律规定。

第五，计算并缴纳清算所得税。这是整个清算过程中的关键步骤，企业必须准确计算应纳税额，并及时缴纳税款。

最后，确定可向股东分配的剩余财产、应付股息等。这部分内容涉及到企业的财务状况和股东权益的保护，需要谨慎处理。

特别需要注意的是，当企业在销售存货或抵顶债务时，如果涉及增值税销项税金与留抵税额的处理，应当允许用销项税金抵减留抵税额。如果留抵税额全部抵顶完毕，则无需再缴纳增值税；但如果留抵税金未完全抵减，并且存货和固定资产作为剩余财产分配给股东时，这部分未抵减的留抵税金将不再退还给企业。

综上所述，企业在进行清算时，必须严格遵守上述规定，确保税务处理的正确性和合法性。这不仅有助于维护企业的良好形象，也有利于保护股东的合法权益。

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